雌雄花鼠在外型上较难区分,只是在发情期雄花鼠的睾丸发育得较大,从腹腔降入体外时才能较为容易地区分。雌花鼠多在4月初发情,表现为鸣叫一天,类似“嘟儿、嘟儿”的声音来招引雄花鼠与之交配。根据观察,如果雌花鼠在发情那天没有找到雄花鼠与之交配,那么它会在11-13天后再次发情。